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細數FDA在腫瘤領域批準的NGS體外診斷產品

發布時間:2017-12-07

近一個月以來,相信大家都已被FDA的兩個針對NGS panel的文章刷屏,毋庸置疑的是美國監管部門對NGS在臨床腫瘤應用的先進理念,也投射出對NGS技術所帶來的技術革命的無限期許。那麽,FDA對NGS在腫瘤領域究竟做了哪些重大決策呢?讓我們來細數FDA在腫瘤治療中獲批的NGS診斷產品。



2016年12月19日,Rubraca獲批用於攜帶BRCA致病突變(同時包括胚係和體係突變)卵巢癌患者的三線及以上治療,FoundationFocus™ CDxBRCA也同時拿到PMA(Premarket Approval)批文,成為第一個獲批的NGS伴隨診斷產品。BRCA1/2基因的突變沒有明顯的熱點突變而且還有多種突變類型,除了常見的SNV、Indel,也包括Large Rearrangement這樣的外顯子水平的結構變異,常規一代測序方法並不能涵蓋以上多種突變類型,而NGS檢測卻可以檢測BRCA基因的全部外顯子,並通過生信算法完成對各種突變類型的分析。Rubraca與FoundationFocus™ CDxBRCA的這一種Codevelopment也是FDA批準CDx的典型代表,即藥物與診斷同步研發、同步提交、同步獲批。


如果說FoundationFocus™ CDxBRCA獲批是因為在BRCA基因突變方式上NGS占據優勢的話,那在2017年6月23日FDA批準Oncomine DX Target Test則標誌著FDA在監管理念上的一大突破,即突破了原有的“One CDx, One Treatment”升級為“One CDx, Three Treatments”。Thermo Fisher的Oncomine DX Target Test包含23個基因,其中BRAF、ROS1、EGFR基因分別獲批用於NSCLC患者對Tafinlar+Mekinist® (dabrafenib with trametinib)、XALKORI® (crizotinib)、IRESSA® (gefitinib)藥物治療方案的選擇,多個有明確治療意義的生物標誌物被整合到一個CDx中,用於相應治療藥物的選擇。


2017年6月29日FDA批準Illumina公司開發Extended RAS Panel對KRAS/NRAS基因明確的56個突變進行IVD檢測,用於Amgen公司Vectibix(panitumumab)在mCRC治療中藥物的選擇。相比於之前的RAS基因檢測,這一檢測擴展到NRAS基因,並對codon12/13之外的突變位點進行檢測,串聯起從文庫製備、測序以及臨床報告生成的全流程分析,依然發揮了NGS可以檢測更多明確位點的優勢以及Illumina作為上遊儀器試劑公司的整合能力。


2017年11月15日,FDA批準了IMPACT研究無疑具有劃時代的意義。該檢測是對實體瘤患者組織樣本的468個基因全部外顯子和特定內含子進行深度測序、通過生信流程進行突變分析和微衛星不穩定MSI分析,結合MSKCC開發的OncoKB數據庫對檢測數據進行解讀。我們在回顧看MSKCC的之前發表的文章時不難發現,這一檢測經過大量的驗證(Validation)及質量控製(Quality Control),並在數據解讀中對基因突變按照臨床意義及證據等級進行劃分,保證測序過程及數據解讀的準確可信。除了已知的臨床意義明確的基因意外,這一IVD產品包括大量相對未有明確臨床意義,但可以增加我們對患者腫瘤認識的基因及其突變,這無疑是FDA在NGS監管領域的又一大突破,具有劃時代的意義。


2017年11月30日,FDA批準了FoundationMedicine的旗艦產品FoundationOne CDx,也就是之前FoundationFocus™ CDxBRCA的母體檢測,用於非小細胞肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、結直腸癌、以及卵巢癌的臨床診療該檢測分析實體瘤患者FFPE樣本的324個基因多種突變及特定融合,並進一步分析兩個基因組學特征——MSI和TMB,檢測結果可用於指導15種靶向藥物的臨床使用。這一檢測是通過FDA最新頒布的Breakthrough Device法案獲得上市許可的第一個IVD產品。以上兩個大型panel的獲批也標誌著“One IVD, more Treatments”時代已經到來。

來源:測序中國